信息科學與工程學院經過三十多年的發展，現下設計算機科學系、通信工程系、軟件工程系、信息系統工程系、計算機工程系、計算機應用基礎教研室和實驗中心。擁有 “嵌入式與網絡計算”、“可信系統與網絡”和“先進通信技術”三個湖南省重點實驗室。并建設有“做中學”國家人才培養模式創新實驗區、湖南省“信息類研究生培養創新基地”、湖南省示范性基礎實驗室“信息技術基礎實驗中心”，以及“計算機網絡與機器學習實驗室”、“網絡軟件與應用實驗室”、“超級計算機與云計算研究所”、“互聯網與媒體實驗室”、“數字媒體研究所”、“生物信息檢測與處理研究所”、“生物信息處理研究所”“大數據處理與行業應用研究中心”等研究實驗室。      

　　　教育部工程中心　　　　　　　　　　　主任：陽王東　　　　副主任：肖德貴　　　

　　　嵌入式與網絡計算省重點實驗室　　　　主任：徐　成（兼）　副主任：楊科華

　　　可信系統與網絡省重點實驗室　　　　　主任：林亞平（兼）　副主任：周四望

　　　先進通信技術省重點實驗室　　　　　　主任：王春華　　　　副主任：伍仁勇

　　　湖南省研究生培養創新基地　　　　　　主任：廖　波（兼）

　　　湖南大學--英特爾多核技術實驗室　　　主任：彭蔓蔓

　　　汽車電子聯合實驗室　　　　　　　　　主任：徐　成

　　　湖南省金信工程實驗室　　　　　　　　主任：羅　娟

　　　計算機網絡與機器學習實驗室　　　　　主任：林亞平教授

　　　網絡軟件與應用實驗室　　　　　　　　主任：楊貫中教授

　　　超級計算機與云計算研究所　　　　　　所長：李肯立教授

　　　互聯網與媒體實驗室　　　　　　　　　主任：孫建華副教授

　　　數字媒體研究所　　　　　　　　　　　所長：高春明教授

　　　湖南大學軟件研究所　　　　　　　　　所長：楊貫中教授

　　　生物信息處理研究所　　　　　　　　　所長：廖波教授

　　　大數據處理與行業應用研究中心　　　　主任：秦拯教授

　　　湖南大學IT治理研究所　　　　　　　　所長：邊耐政副教授

　　　湖南大學嵌入式系統研究所　　　　　　所長：李仁發教授

　　　網絡與信息安全研究所　　　　　　　　主任：彭飛

　　　大數據安全與保密技術研究所　　　　　主任：胡玉鵬